Prevalence and Resistance Profiles of Multidrug‑Resistant Bacteria in Severely Malnourished Children in Niger: An Analytical Cross‑Sectional Study at The Intensive Nutritional Rehabilitation Centre of Zinder National Hospital

Prévalence et Profils de Résistance des Bactéries Multirésistantes Chez les Enfants Malnutris au Niger : Une Étude Transversale Analytique au Centre de Récupération Nutritionnelle Intensive de l'Hôpital National de Zinder

Abstract

RÉSUMÉ
Introduction. Le portage asymptomatique de bactéries résistantes aux antibiotiques constitue un problème majeur de santé publique dans les hôpitaux, particulièrement chez les patients malnutris, dont l'immunodépression favorise l'acquisition et la dissémination de ces souches. Au Niger, les données sur ce portage restent limitées. Cette étude a déterminé la prévalence du portage de bactéries multirésistantes (BMR) chez les enfants malnutris sévères hospitalisés au Centre de Récupération Nutritionnelle Intensive (CRENI) de l'Hôpital National de Zinder et décrit les profils de résistance. Méthodes. Étude transversale descriptive et analytique menée d'avril à juillet 2023, incluant 32 participants (16 enfants de moins de 5 ans et leurs 16 mères accompagnatrices). Les échantillons de selles ont été prélevés et analysés au laboratoire de l'HNZ, puis confirmés par phénotypage au CHU de Montpellier. Résultats. La prévalence du portage de BMR était de 34,4 % (11/32). Escherichia coli était l'espèce majoritaire (90,9 %, n=10/11), suivie de Shigella sp. (9,1 %, n=1/11). Toutes les BMR (11/11) ont été isolées chez les enfants, aucune chez les mères. Les phénotypes de résistance étaient dominés par la BLSE seule (45,4 %, n=5/11), suivis des associations BLSE + carbapénémase (18,2 %, n=2/11), BLSE + suspicion d'OXA-48 (18,2 %, n=2/11), BLSE + suspicion OXA-48/carbapénémase (9,1 %, n=1/11) et suspicion BLSE seule (9,1 %, n=1/11). Conclusion. Le portage de BMR, dominé par E. coli producteur de BLSE, touche un enfant malnutri sur trois à Zinder. Ces résultats soulignent l'urgence de renforcer les mesures d'hygiène, de mettre en place une politique de prescription antibiotique rationnelle et de surveiller l'émergence des carbapénémases dans cette population vulnérable.

ABSTRACT
Introduction. Asymptomatic carriage of antibiotic‑resistant bacteria is a major public health concern in hospitals, particularly in malnourished patients whose immunosuppression favours acquisition and dissemination of these strains. In Niger, data on such carriage remain limited. This study determined the prevalence of multidrug‑resistant (MDR) bacteria carriage in severely malnourished children hospitalised in the Intensive Nutritional Rehabilitation Centre (CRENI) of Zinder National Hospital and described the resistance profiles. Methods. A descriptive and analytical cross‑sectional study was conducted from April to July 2023, including 32 participants (16 children under 5 years and their 16 accompanying mothers). Stool samples were collected, analysed at the HNZ laboratory, and confirmed by phenotyping at Montpellier University Hospital. Results. The prevalence of MDR carriage was 34.4% (11/32). Escherichia coli was the predominant species (90.9%, n=10/11), followed by Shigella sp. (9.1%, n=1/11). All MDR isolates (11/11) were found in children, none in mothers. Resistance phenotypes were dominated by ESBL alone (45.4%, n=5/11), followed by ESBL + carbapenemase (18.2%, n=2/11), ESBL + suspected OXA‑48 (18.2%, n=2/11), ESBL + suspected OXA‑48/carbapenemase (9.1%, n=1/11) and suspected ESBL alone (9.1%, n=1/11). Conclusion. MDR carriage, dominated by ESBL‑producing E. coli, affects one in three malnourished children in Zinder. These findings underscore the urgent need to strengthen hygiene measures, implement rational antibiotic prescribing policies, and monitor the emergence of carbapenemases in this vulnerable population.