Antifungal Susceptibility Profiles of Candida Species Isolated from Lower Respiratory Tract Infections in Yaoundé, Cameroon: A Prospective Cross-Sectional Study
Profil de Sensibilité aux Antifongiques des Espèces de Candida Isolées lors d'Infections Respiratoires Basses à Yaoundé, Cameroun : Une Étude Transversale Prospective
DOI:
https://doi.org/10.5281/zenodo.18327468Keywords:
Respiratory infection, yeast, antifungals, sensitivity, YaoundéAbstract
RÉSUMÉ
Introduction. Les candidoses respiratoires représentent un défi diagnostique et thérapeutique croissant en Afrique subsaharienne. Bien que Candida albicans demeure le principal agent pathogène, l'émergence d'espèces non-albicans aux profils de sensibilité imprévisibles complexifie la prise en charge. Nous avons mené cette étude pour déterminer le profil de sensibilité aux antifongiques des levures isolées chez des patients souffrant d'infections des voies respiratoires basses à l'Hôpital Jamot de Yaoundé. Méthodologie. Entre mai 2023 et août 2025, nous avons réalisé une étude transversale et prospective incluant 523 patients. L'identification des souches a été effectuée par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) et la sensibilité aux antifongiques a été évaluée par la méthode de microdilution colorimétrique. Nous avons déterminé les concentrations minimales inhibitrices (CMI) pour neuf agents antifongiques, conformément aux protocoles de référence. Résultats. Le taux de colonisation ou d'infection fongique s'élevait à 47,2 % ($n=247$). Les trois espèces majoritaires, Candida albicans (70,9 %), Candida tropicalis (7,3 %) et Candida parapsilosis (6,5 %), couvraient 84,7 % du spectre identifié. Candida albicans affichait une sensibilité remarquable de 97,1 % à l'amphotéricine B ainsi qu'aux échinocandines (anidulafungine, caspofungine, micafungine). Nous avons noté une résistance marginale au fluconazole (0,6 %) chez C. albicans, tandis que C. krusei présentait, comme attendu, une résistance intrinsèque totale à cet azolé. Des espèces rares comme Candidozyma haemulii montraient une sensibilité réduite à l'amphotéricine B (50 %). Conclusion. L'amphotéricine B et les échinocandines constituent les options thérapeutiques les plus fiables contre les levures respiratoires à Yaoundé. La présence d'espèces non-albicans aux sensibilités variables souligne la nécessité d'une identification précise pour orienter l'antifongithérapie et limiter l'émergence de résistances en milieu hospitalier camerounais.
ABSTRACT
Introduction. Respiratory candidiasis represents a growing diagnostic and therapeutic challenge in Sub-Saharan Africa. While Candida albicans remains the primary pathogen, the emergence of non-albicans species with unpredictable susceptibility profiles complicates management. We conducted this study to determine the antifungal susceptibility profile of yeasts isolated from patients with lower respiratory tract infections at the Jamot Hospital in Yaoundé. Methodology. Between May 2023 and August 2025, we performed a prospective cross-sectional study including 523 patients. Strain identification was performed using mass spectrometry (MALDI-TOF), and antifungal susceptibility was evaluated using the colorimetric microdilution method. We determined the minimum inhibitory concentrations (MIC) for nine antifungal agents according to reference protocols. Results. The fungal colonization or infection rate was 47.2% ($n=247$). The three major species, Candida albicans (70.9%), Candida tropicalis (7.3%), and Candida parapsilosis (6.5%), accounted for 84.7% of the identified isolates. Candida albicans showed remarkable sensitivity (97.1%) to amphotericin B and echinocandins (anidulafungin, caspofungin, micafungin). We noted marginal resistance to fluconazole (0.6%) in C. albicans, while C. krusei exhibited total intrinsic resistance to this azole. Rare species such as Candidozyma haemulii showed reduced susceptibility to amphotericin B (50%). Conclusion. Amphotericin B and echinocandins are the most reliable therapeutic options for respiratory yeasts in Yaoundé. The presence of non-albicans species with varying sensitivities highlights the need for precise identification to guide antifungal therapy and limit the emergence of resistance within Cameroonian hospitals.
References
1. Sarah Quadros Santos Kessler 11, Pauline Mastella Lang 22, Tatiane Silva Dal-Pizzol, Francisco Montagner 1, Resistance profiles to antifungal agents in Candida albicans isolated from human oral cavities: systematic review and meta-analysis. Clin Oral Investig. 2022 Nov ;26(11) :6479-6489
2. Maire AM, Gumez MA, Rios-Olivares E, Hunter-Mellado RF, SIDA définissant la prévalence des néoplasmes dans une cohorte de patients infectés par le VIH, avant et après un traitement antirétroviral hautement actif. Ethn Dis.2008 ;18: S2–189–94, Article libre PMC, PubMed
3. L-W, Fu J-Y, Hua H, Yan A-M. Efficacité et sécurité du miconazole pour la candidose orale : examen systématique et méta-analyse. Dis oral. 2016 ;22:185-195. doi: 10.1111/odi.12380. DOI,PubMedGoogle Scholar
4. Pfaller MA, Boyken LB, Hollis RJ, Kroeger J, Messer SA, Tendolkar S, Diekema DJ. 2011. Validation des mesures de CMI du posaconazole et du voriconazole sur 24 heures par rapport à la méthode de référence de microdilution en bouillon CLSI sur 48 heures : application des valeurs limites épidémiologiques. J Clin Microbiol. Avril 2011 ;49(4) :1274-9.
5. Pfaller MA, Diekema DJ, Jones RN, Castanheira M. Utilisation de l'anidulafungine comme marqueur de substitution pour prédire la sensibilité et la résistance à la caspofungine parmi 4 290 isolats cliniques de Candida en utilisant les méthodes CLSI et les critères d'interprétation. J Clin Microbiol .2014 ;52: 3223–3229. Doi: 10.1128/JCM.00782
6. Shin JH, Kim MN, Jang SJ, Ju MY, Kim SH, Shin MG, Suh SP, Ryang DW. Détection de la résistance à l'amphotéricine B chez Candida haemulonii et les espèces étroitement apparentées à l'aide du système de sensibilité aux levures Etest, Vitek-2 et des méthodes de microdilution en bouillon CLSI et EUCAST. J Clin Microbiol.2012 ;50 : 1852–1855. doi : 10.1128/JCM.06440-11
7. Gonsu Kamga H, Kechia Agem FA, Tegankam Dorice, Toukam Michel, Sando Zacharie, Moyou Somo R. Antifungal susceptibility patterns among the clinical isolates of Candida Spp in digestive candidosis in the HIV-positive subjects. Health Sci. Dis: Vol 15 (3) July August September 2014 Available at www.hsd-fmsb.org
8. Quind's G, Gil-Alonso S, Marcos-Arias C, et al. Outils thérapeutiques pour la candidose orale : médicaments antifongiques actuels et nouveaux. Med Oral Patol Oral Cir Bucal. 2019;24: e172-e180. doi: 10.4317/medoral.22978. DOI, Article libre PMC,PubMed, Google Scholar-
9. Pappas PG et al ,2016, Clinical practice guidelines for the management of candidiasis: 2016 update by the Infectious Diseases Society of America. Clin Infect Dis 62(4):e1-50. 10.1093/cid/civ933 DOI, Article libre PMCPubMed
10. De Demitto FO, do Amaral RCR, Biasi RP, et al. Suscetibilidade a antifangicos in vitro de Candida spp. empacientes do hospital Universitario Regional de Maring-PR. J Bras Patol E Med Lab. 2012 :48:315-322. doi: 10.1590/S1676-24442012000500003. DOI, Google Scholar-
11. Do Silva MRR, Costa MR, Miranda ATB, et al. Évaluation de la méthode de bouillon d'Etest et de macrodilution pour les tests de sensibilité antifongique des souches de Candida sp isolées à partir de cavités buccales des patients atteints du SIDA. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2002; 44:121-125. doi: 10.1590/S0036-46652002000300002. DOI, ubMed, Google Scholar
12. Wanger A, Mills K, Nelson PW, Rex JH. Comparaison de la méthode de macrodilution du bouillon des normes cliniques du Comité national pour les tests de sensibilité antifongiques : capacité accrue à détecter les isolats de Candida résistants à l'amphotéricine B. Agents antimicrobiens Chemother. 1995 ;39:2520-2522. doi: 10.1128/AAC.39.11.2520. DOI, Article libre PMC, PubMed, Google Scholar-
13. de Jonior AA, V, Menezes EA, Cunha FA, et al. Compparaçao entre microdiluiçao e disco difusao para o teste de susceptibilidade aos antif'ngicos contra Candida spp. Semina Ciênc Biolôgicas E Sa'de. 2012; 33:135-142. doi: 10.5433/1679-0367.2012v33n1p135. DOI, Google Scholar-
14. Bhattacharya S, Sae-Tia S, Fries BC. Candidose et mécanismes de résistance antifongique. Antibiotiques. 2020 ;9:312. doi: 10.3390/antibiotiques9060312. DOI, Article libre PMC, PubMed, Google Scholar-
15. Prasad R, Nair R, Banerjee A. Mécanismes émergents de résistance aux médicaments chez Candida albicans. Prog Mol Subcell Biol. 2019 ;58:135–153. doi: 10.1007/978-3-030-13035-0-0-6. DOI, PubMed, Google Scholar
16. Vincent BM, Lancaster AK, Scherz-Shouval R, et al. Les compromis de l’adéquation limitent l'évolution de la résistance à l'amphotéricine B. PLOS Biol. 2013 ;11: e1001692. doi: 10.1371/journal.pbio.1001692. DOI, Article libre PMC, PubMed, Google Scholar-
17. Anderson JB. Évolution de la résistance aux antifongiques : mécanismes et conditions d'utilisation des agents pathogènes. Nat Rev Microbiol. 2005; 3:547-556. doi: 10.1038/nrmicro1179. DOI, PubMed, Google Scholar-
18. Firooz A, Nafisi S, Maibach HI. Nouvelles stratégies d'administration de médicaments pour améliorer l'action antifongique de l'éconazole. Int J Pharm. 2015; 495:5599-607. doi: 10.1016/j.ijpharm.2015.09.015. DOI, PubMed, Google Scholar
19. Vazquez JA, Sobel JD. Comprimés mucoadhésifs à miconazole : un nouveau système d'administration. Clin Infect Dis Off Publ Dis Dis Dis Soc Am. 2012 ;54:1480-1484. doi: 10.1093/cid/cis205. DOI, PubMed, Google Scholar
20. Samaranayake LP, Holmstrup P. candidose buccale et infection par le virus de l'immunodéficience humaine. J Oral Pathol Med Off Publ Int Assoc Oral Pathol Am Acad Pathol Oral Pathol. 1989 ;18 :554-564. doi: 10.1111/j.1600-0714. 1989.tb01552. x. DOI, PubMed, Google Scholar-
21. Garcia-Cuesta C, Sarrion-Pérez M-G, Sagan JV. Traitement actuel de la candidose orale : revue de la littérature. J Clin Exp Dent. 2014 ;6:e576-582. doi: 10.4317/jced.51798. ,DOI,Article libre PMC, PubMedGoogle Scholar-
22. Thompson GR, Patel PK, Kirkpatrick WR, et al. Candidose oropharyngée à l'ère du traitement antirétroviral. Surg oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod. 2010:109:488-495 doi: 10.1016/j.tripleo.2009.11.026. DOI, Article libre PMC, PubMed, Google Scholar
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